По мнению специалистов, источниками любой науки рукопашного боя, в том числе и ниндзютсу, являются:

- даосская философия с ее идеями взаимодействия Инь и Ян; Пустоты, Недеяния, Мягкости, Естественности, Метаморфоз; отношений пяти первоэлементов; 

- йога: индийская, тантрическая, даосская, буддийская, - включающая в себя психотренинг и стремление к физическому и духовному совершенству;

- китайско-тибетская медицина, изучающая циркуляцию жизненной энергии Ци, меридианы, проходящие в человеческом теле и точки их выхода на поверхность; 

- наблюдение за повадками самых различных животных и подражание им - именно из этой "бионики древности" появились стили рукопашного боя, названные по именам животных;

- военная наука древнего Китая; 

- система дзэн-буддизма с ее психотехникой, т.е. едва ли не самое главное в ниндзютсу - концентрация и самовнушение.

Кроме того, специалисты считают, что любое восточное военное искусство состоит из трех частей: 

1. Конфуцианские этические нормы формирования личности.

2. Конкретная методика обучения (она, конечно, в каждом виде борьбы своя, но есть и общие моменты - подготовка тела происходит одновременно с перестройкой психики, боец работает с пятью стихиями, с предметами и с формами-образами). 

3. Приемы борьбы.

В последующих главах мы обратимся к источникам и составным частям ниндзютсу, которые основываются на образе мыслей, берущем начало в восточной философии.