Ниндзя были воинами и поэтому носили при себе оружие для нападения и защиты. Однако в отличие от обычных солдат, единственное оружие которых выполняло единственную функцию, ниндзя предъявляли к своему оружию три требования. Поскольку тайные воины перемещались быстро и бесшумно, то их оружие должно было быть, во-первых, легким, во-вторых, компактным и, в-третьих, легкоразборным. Каждый тип его разрабатывался с учетом множества самых различных ситуаций, и ниндзя должен был виртуозно владеть им.

Работая в одиночку, ниндзя мог рассчитывать только на самого себя, а высокая мера ответственности за порученное дело (сбор информации, доставка донесений, убийство) не допускала ни малейшей вероятности провала. 

В средневековой Японии большинство воинов носили меч (katana) как основное оружие самозащиты. Для самурая меч был его правой рукой, семейной реликвией и душой. Но меч не был доступен большей части общества в качестве основной части снаряжения. Долгое время простому люду было запрещено носить мечи, поэтому большинство носило деревянное оружие: дубинку или маленький нож на поясе.

Секретный меч (синобигатана, или ниндзя - то) 

Катаной можно было только рубить, и тренировки самураев сводились, в основном, к отработке рубящих движений.

Блоки и отражение ударов не применялись, так как при этом клинок мог зазубриться. Меч, который носили ниндзя, назывался синобигатана (ниндзя-то). В отличие от самурайского, он использовался различными способами в дополнение к обычной рубке. Меч ниндзя был короче (клинок около пятидесяти сантиметров длиной) и носился наискось за спиной, с рукоятью, торчащей над правым плечом. К ножнам (saya) был привязан шнур (sageo) длиной до нескольких метров. Меч имел большую квадратную гарду (tsuba), в отличие от самурайского, гарда которого была маленькой и овальной. (Рис. 16,16а). 

Ниндзя - то использовался , помимо прочего,следующими необычными способами.

1. Если ниндзя хотел перелезть через стену, он прислонял к ней меч, становился на гарду и, держа сагео в зубах, взбирался наверх, а затем втаскивал за собой меч. ( Рис. 17). 

2. Сражаясь с вооруженным копьем врагом или окруженный несколькими противниками, ниндзя пробивался вперед, вращая ножны над головой за сагео. (Рис.18).

3. Бесшумно пробираясь в темноте по чужому дому, невозможно увидеть или услышать, есть ли в комнате кто-нибудь еще. Поэтому ниндзя брал сагео в зубы, в то время как правая рука его держала меч, примерно на три четверти вытянутый из ножен. Если конец ножен утыкался во врага, ниндзя давал им упасть на землю и мог колоть и рубить обнаженным клинком. ( Рис. 19 ). 

4. Ниндзя всегда носил на дне ножен смесь песка, молотого перца и железных опилок. Когда меч был вытащен, можно было взмахом ножен метнуть эту смесь в глаза врагу.

5. Наконечник ножен можно было снять и тогда они использовались как духовая или дыхательная трубка.